Dès le Ve siècle avant J.-C., Platon livre une première chronique relatant l'histoire puis la disparition de l'Atlantide, île mystérieuse située en Méditerranée orientale, non loin de l'actuelle Crète. L'Atlantide aurait abrité, à l'âge du bronze, la fastueuse civilisation minoenne. Remontant le temps, ce documentaire mêle deux destins : celui d'un jeune Minoen emporté par le tremblement de terre, et celui d'un jeune Américain qui devient géologue après avoir survécu à un séisme à Hawaii. Aujourd'hui, Floyd McCoy travaille avec une équipe allemande. Ils analysent les phénomènes sismiques, notamment lors de plongées sous-marines, et réalisent des animations en 3D pour reproduire les mouvements tectoniques.